Nel 1659, il tedesco J.R. Graubel produsse nitrato di ammonio per la prima volta. Alla fine del XIX secolo, gli europei usavano solfato di ammonio e salnitro cileno per sottoporsi a una reazione di metatesi per produrre nitrato di ammonio. In seguito, a causa dello sviluppo su larga scala dell'industria dell'ammoniaca sintetica, la produzione di nitrato di ammonio ottenne abbondanti materie prime e si sviluppò rapidamente a metà del XX secolo. Durante la seconda guerra mondiale, alcuni paesi hanno appositamente istituito impianti di nitrato di ammonio per produrre esplosivi. Negli anni '60, il nitrato di ammonio era la principale specie di fertilizzante azotato. La Cina ha fondato un certo numero di fabbriche di nitrato di ammonio negli anni '50.
Negli anni '40, al fine di evitare che il nitrato di ammonio agricolo assorbisca umidità e agglomerazione, era rivestito con paraffina e altre sostanze organiche. Ci sono state esplosioni causate da un incendio nel trasporto marittimo. Pertanto, alcuni paesi hanno formulato norme di gestione sulla produzione, lo stoccaggio e il trasporto di nitrato di ammonio agricolo. Alcuni paesi vietano persino il trasporto e l'uso diretto del nitrato di ammonio come fertilizzante e consentono solo l'uso di nitrato di ammonio di calcio mescolato con carbonato di calcio.
In seguito, a causa della padronanza dell'uso del nitrato di ammonio, alcuni paesi come Francia, Unione Sovietica, Romania, Stati Uniti e Regno Unito permisero che il nitrato di ammonio fosse usato direttamente come fertilizzante, ma stabilirono standard per l'uso sicuro dei prodotti.